大清王朝曾经拥有“康乾盛世”的辉煌，走过二百年历史之后，逐渐走入衰亡时期。到19世紀上半叶，英国开始大量向中国贩售鸦片。清廷采取禁烟措施后，于道光末年1840年中英鸦片战争爆发。鸦片战争失败，咸丰帝即位，标志大清皇朝进入末期。自此以后，迫于西方列强入侵，清廷签订起了一系列不平等条约，第一个是鸦片战爭失败所签的《南京条约》、接着是亚罗船事件和广西教案为导火索的中英法战爭失败而签的《天津条约》和《北京条约》。这些条约强迫清政府割地赔款、开放通商口岸。从此，中华民族门户被钢枪利炮打开，西方的科学技术，文化宗教开始侵入，中华民族的悠久文化与传统价值开始受到冲击。

　　自此清廷的威严日趋没落。反抗清廷的运动纷纷出现，其中規模最大的太平天国运动，甚至一度对清廷的统治构成了严重威胁。同时外来掠夺与侵略自鸦片战争一直没有结束。光绪二十六年（公元1900），义和团起事，仇杀外国人，引起英、俄、法、德、美、日、义、奥八国共组成联军，攻陷北京, 光绪和慈禧太后逃亡西安。 光绪二十七年（公元1901），岁次辛丑，在北京与各国所订立的《辛丑条约》，更是不平等条约中最苛刻的。

　　伴随历史未曾有过的巨大变迁，瘟疫以历史上未曾有过的频繁纷纷发生。

　　咸丰五年(1855) 六月，清水大疫。六年五月，咸宁大疫。这一年，太平军包围安徽颍上城，与清军发生激战。后太平军撤离，城内疾疫大起，死者数千。十一年春，即墨大疫。六月，黃县大疫。

　　同治初年连年特大瘟疫。瘟疫以霍乱 (吊脚痧、转筋痧) 这种烈性急性传染病流行为主，以及痢疾等其它多种传染病掺杂在内流行，死亡人数估计超过百万。如“同治元年秋，清苑大疫；滦州大疫；宁津大疫；曲阳、东光大疫；临榆、抚宁大疫；莘县大疫；临朐大疫；登州府属大疫，死者无算。”又如贵州发生疟疾大流行，十死八九，“非癀病，即摆子”。

　　同治二年(1863年)，六月，上海疫疾流行，死亡的人数超过二万余人。江苏常熟在六七月间，瘟疫传染出现高潮，染病死亡的人数众多。吴江地区又死了很多人，出殡时连抬棺材的人也找不到。入秋，浙北吊脚痧流行，死伤无数。这年左宗棠被授予闽浙总督饼浙江巡抚后，指挥清军进攻富阳的太平军。清军感染上疟疾万余人，得病众多，左宗棠自己也未能幸免。

　　这次瘟疫不只是限于江浙上海一带。夏天，湖南的嘉禾、永绥等地都有大疫流行。陕西瘟疫也全省范围内流传。七月，从四川攻人陕西的李永和、蓝大顺起义军联合太平军包围了汉中。汉中的知府、道员染上疫病先后病死。被包围时间一久，城内缺粮少衣，疾疫流传，每天死亡士兵有千余人。不久，潼关地区流传起瘟疫，守关的士兵一大半染病身亡。时人余澍畴《秦陇回务纪略》中对陕西的疫情记述：“自夏徂秋，疫疠大作，死亡甚多，至有全家无一生者。”“无沧富贵贫贱，半死刀兵，半死疫疠，通省皆然。”

　　同治三年(1864年)，清军和太平军在苏浙战场进行最后决战。随着太平军的撤退，清军进入，苏南、浙北地区疫病再起。这年四月，太平军从常熟撤出。不久，清军通过激烈的战斗夺回了南京，入城后军营中疾疫又流传开来。这年四月，由于在浙江战线全面失利，太平军从湖州撤出。六月，伴随高温天气，湖州发生疫病流行。

　　同治初年连续三年特大疫后，以后一直瘟疫不断。 如史载“五年五月，永昌大疫。六年二月，黄县大疫。七月，曹县大疫。九月，通州疫，泰安大疫。八年六月，宁远、秦州大疫。七月，麻城大疫。九年秋，麻城大疫。冬，无极大疫。十年五月，孝义大疫。六月，麻城大疫。十一年夏，新城大疫，武昌县大疫。”

　　光绪四年(1878年)，京师及直隶春寒严重，进入夏季后，饥民中瘟疫流行，京师、天津、保定府都出现了严重疫疾，受疫范围较广。1890年以后广东各地鼠疫不断，1892年，四川许多地方流行麻脚痧，也造成了严重的死亡。光绪二十年（1894年），鼠疫曾发现于香港，后即酿成疫疠。流行于世界。1896年台湾也有鼠疫蔓延，光绪二十八年（1902年）六月，京津地区爆发霍乱。死亡超过一万余人。直隶总督袁世凯在六月初十日给徐世昌的信函中说：“近日疫症大作，伤人甚多。”这年黑龙江瑷珲也出现严重的霍乱转筋，半个月后，“市断人稀，街面几无人迹”，每日死亡有七、八百人。

　　清朝走到了末代皇帝宣统皇帝（1908年－1911年），也称清末帝。宣统皇帝登上皇位时年仅三岁。在位一年后，中国东北发生特大鼠疫。

　　1910年10月25日，满洲里首发鼠疫，11月8日即传至北满中心哈尔滨。之后由北向南，沿着铁路交通线爆发流行。从满洲里而哈尔滨而长春而吉林省城吉林。据有关纪录[4]，“凡延近铁路区城，逐渐波及”。双城知府报告说“距车站铁轨近，疫盛时疫毙最多”。鼠疫沿铁路沿线迅速向内地蔓延，一时“疫气蔓延，人心危惧”。“死尸所在枕藉，形状尤极惨然”，从城市到乡村都笼罩在死亡的威胁之中。有人形容道：“一家十口或半死于疫，一家数口或尽死于疫。子或朝痛其父之疫死，及暮并其子而疫死者有之；弟或朝痛其兄之疫死，及暮并其弟而疫死者有之；妻或朝痛其夫之疫死，及暮并其妻而疫死者又有之。”疫情如江河决堤，不可遏止，不仅横扫东北平原，而且波及河北、山东等地。

　　鼠疫出现后，清政府下令各处严防。1910年12月，指派天津北洋陆军医学院副监督伍连德为全权总医官赴哈尔滨，进行鼠疫防疫工作，随后抽调所能调动的陆军军医学堂、北洋医学堂和协和医学院的医护人员以及直隶、山东等地方的一些医生，前往东北支援。在伍连德等的建议下，清廷组建各级防疫组织、颁布各种防疫法规，以及采取了隔断交通、对病人及疑似病人实施隔离、焚化尸体、对疫区严格消毒等具体有效的防疫措施。尽管如此，这次东北鼠疫造成了多达六万多人死亡，并直接导致了交通停止，各行歇业，商业不振，加速了本已岌岌可危的清王朝的崩溃。1911年10月，武昌起义为标志的辛亥革命爆发，各省随后纷纷响应宣布独立，大清皇朝迅速分崩离析。清帝于1912年2月12日宣告退位。

　　这次鼠疫送走了清朝。与历史上不同，这次鼠疫结束了中华民族史上最大一台戏，大王朝时代。中华民族的王朝历史这台戏，以夏禹拉开序幕，演绎了无数跌宕起伏的情节，展示了无比气势磅礴的画卷，一气横贯上下五千年。到宣统时结束了，结束的那么的微弱，消失的那么彻底。在辛亥革命一记无力的鼓声中，王朝时代拉下了最后的帷幕。